激光共聚焦顯微鏡主要應用范圍1. 組織和細胞中的定量熒光測定

常用于原位分子雜交、腫瘤細胞凋亡觀察、單個活細胞水平的 DNA 損傷及修復等定量分析。

2. 細胞間通訊的研究

用于研究胚胎發生、生殖發育、神經生物學、腫瘤發生等過程中縫隙連接通訊的基本機制和作用，也可用于鑒別對縫隙連接作用有潛在毒性的化學物質。

3. 細胞物理化學測定

能對細胞的溶酶體、線粒體、內質網、細胞骨架、結構性蛋白質、DNA、RNA、酶和受體分子等細胞內特異結構的含量、組分及分布進行定量、定性、定時及定位測定。

4. 細胞內鈣離子和 pH 值動態分析

利用熒光探針，激光掃描共聚焦顯微鏡可以測量單個細胞內 pH 和多種離子(Ca2+、K+、Na+、Mg2+)在活細胞內的濃度及變化。

5.三維圖像的重建

6.熒光漂白恢復技術

可通過觀察已發生熒光漂白細胞其熒光恢復過程的變化量來分析細胞內蛋白質運輸、受體在細胞膜上的流動和大分子組裝等細胞生物學過程。

7.長時程觀察細胞遷移和生長

8.在細胞及分子生物學基礎研究中的應用

還可以對貼壁的單個細胞或細胞群的胞內、胞外熒光作定位、定性、定量及實時分析，并對胞內成分如線粒體、內質網、高爾基體、DNA、RNA、Ca2+、Mg2+、Na+ 等的分布、含量等進行測定及動態觀察，使細胞結構和功能方面的研究達到分子水平。

9.在腫瘤和抗癌藥物篩選研究中的應用

可對單標記或者多標記細胞、組織標本及活細胞進行重復性J佳的熒光定量分析，從而對腫瘤細胞的抗原表達、細胞結構特征，抗腫瘤藥物的作用及機制等方面定量化。

10.在血液病學和醫學免疫學研究中的應用

準確細胞定位的同時有效鑒定免疫細胞的性質。

11.在大腦和神經科學中的應用

激光掃描共聚焦顯微鏡能觀察神經軸突的三維結構，因此應用激光掃描共聚焦顯微鏡 有可能觀察到普通光鏡下未能發現的神經組織的細微病變。

12.在眼科研究中的應用

利用激光掃描共聚焦顯微鏡可以觀察晶狀體，角膜、視網膜、虹膜和睫狀體的結構和病理變化。

13.在骨科研究領域中的應用

在觀測骨細胞形態學研究、骨細胞特異性蛋白（骨鈣素）以及骨細胞之間的相互作用具有顯著的優勢。